软件？

如果你说的是软件在线自动升级，新的文件会覆盖原来的文件，同一个软件桌面图标不一定改变。如果你说的是下载的软件，一般是要将旧的软件卸载才可以安装新的软件。退一步将原来软件没有卸载又下载了新的软件，不是存储在一个文件夹里，就是有两个软件同时存在，这样的话桌面就存在这两个软件的图标。

有，分别下载同一软件，放在不同的系统盘（比如C和D盘），然后将C盘的软件升级了，而D盘的不动，这样就能使用2个不同的软件了，如果说是同一目录下的软件的话，是不能保留的。

也可以将统一软件分成2个不同的文件夹也行。同时桌面上可以保留2个图标。当然图标名字当然不一样了。